一、小分子化学学物质聚类
1、Materials Studio与CSD联用教程主要介绍了如何利用CSD数据库信息辅助Materials Studio进行小分子化合物多晶型预测及结果分析，核心步骤包括项目创建、结构绘制与优化、多晶型预测、CSD数据库查询及结果对比验证。
2、前期准备 文件整理：将每个配体单独放置在一个没有路径的文件夹中。将Autogrid4和autodock4程序复制到此文件夹中。小分子与大分子PDB文件的准备：小分子配体：使用Chemdraw软件绘制小分子结构，并保存为.sdf格式。
3、 内容与分类代谢组学（metabonomics/metabolomics）是继基因组学、转录组学、蛋白质组学后兴起的新兴“组学”，以定量描述生物体内代谢物变化为目标。
4、GC-MS非靶标代谢组学是一种通过气质联用（GC-MS）技术检测生物体受外界刺激前后体内大多数小分子代谢物动态变化的方法，旨在寻找实验组和对照组间显著变化的代谢物，并研究其与生理病理变化的相关关系，主要针对分子量1500Da以内的小分子物质。
二、MaterialsStudio教程(十七)MaterialsStudio和CSD联用
1、Materials Studio官方教程：CCDC——乙内酰脲潜在多晶型的氢键分析，主要介绍了通过氢键基序对乙内酰脲多晶型结果进行分类的方法，涉及Materials Visualizer、CCDC等模块，步骤包括绘制分子结构、定义官能团和施主/受主位点、利用CSD查询相关结构、为Polymorph输出分配基序信息并评分排名靠前的结构。
2、Materials Studio和CSD联用教程（续）主要围绕将实验粉末X射线光谱与CSD中收录的化合物自动生成的光谱进行比较展开，具体步骤如下：建立新项目 打开“New Project”对话框，输入“crystal_ID”作为项目名，单击“OK”按钮创建新项目。
3、确保Materials Studio软件已正确安装，并具备VAMP、Polymorph、Forcite等模块的使用权限。创建项目并绘制分子结构 创建项目：在Materials Studio中，右键单击“Project Explorer”中的空白区域，选择“New | Project”，创建一个名为“CSD”的新项目。
4、功能强大，覆盖多场景需求全模块支持：MS集成了建模、结构优化、差分电荷密度、STM模拟、磁性计算、色散校正等模块，可完成从晶体结构构建到性能预测的全流程分析。跨软件协同：支持与CSD（剑桥结构数据库）联用，扩展材料数据获取渠道；通过LDA+U方法处理强关联体系，提升计算精度。
5、Materials Studio官方教程：CCDC模块——Materials Studio和CSD联用，旨在说明Materials Studio与CSD的结合使用方法，通过利用CSD中的信息为Materials Studio计算结果添加可用信息，预测小分子化合物的多晶型并与已知晶体结构比较。
三、技术介绍GC-MS非靶标代谢组学
1、高靶代谢组报告是一种基于高通量靶向代谢组检测技术的实验结果，该技术结合了非靶标代谢组学和靶标代谢组学的优点，实现了高通量、高灵敏度的靶标代谢物检测。
2、诺米代谢风味组学基于色谱质谱联用技术对风味物质进行鉴定，采用全二维气相色谱-飞行时间质谱联用（GC×GC-TOFMS）技术，有效解决了挥发性物质检测数量过少的问题，并且凭借强大的特色整合数据库，实现了多维度的物质风味注释，再以成熟的非靶向代谢组学分析流程为依托。
3、追踪覆盖范围高，能够对上千个代谢物同时进行稳定同位素标记的追踪。对稳定同位素标记代谢物的定量准确性高且可重复性好。大规模数据分析的假阳性低。能够发现新的代谢反应和通路。
4、UHPLC-QTOF-MS非靶标代谢组学是一种基于超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱联用技术，对生物样本中未知代谢物进行全面检测与分析的方法，旨在寻找实验组与对照组间显著变化的代谢物，并研究其与生理病理变化的关系。
5、首先通过非靶标代谢组对40例AIS患者和40例健康血清样本进行检测，筛选出26个差异代谢物质。然后用靶标代谢组学（MRM定制靶标检测）对潜在标志物进行验证。研究结果：筛选出5种可以作为AIS的潜在生物标志物，为AIS未来的诊断和治疗发展提供了研究基础。
四、autodock分子对接教程经验(自学不一定对)
1、Autodock分子对接流程步骤：准备小分子和大分子的PDB文件 小分子配体的准备：使用Chemdraw画出小分子结构，并保存为mol格式。用Chem3D打开mol格式文件，并另存为pdb文件。大分子受体的准备：从RCSB网站下载所需的大分子受体PDB文件。
2、进行分子对接：点击“Run>Run AutoDock”，在弹出的窗口中点击Browse，选择刚才保存的dpf文件（如protein_ligand.dpf），点击打开。Nice Level设置为20，然后点击Launch运行。查看对接结果 删除配体分子：点击“Edit>Delete>Delete All Molecules>CONTINUE”删除配体分子。
3、Autodock Vina进行分子对接的详细教程如下：安装与准备：下载软件：你需要下载Autodock Vina软件包。为了方便新手操作，推荐使用MGTtools组件，它可以提供autodock vina的可视化功能，使得操作更为直观。设置工作路径：确保你的工作路径设置正确，以便软件能够顺利查找和处理文件。
五、【分子生物学知识点分享】代谢组学-反映机体[真正发生了什么]的科学...
1、代谢组学是反映机体“真正发生了什么”的科学，它通过定量分析生物体内代谢物变化，揭示生命活动的终端信息，是系统生物学的重要组成部分。 内容与分类代谢组学（metabonomics/metabolomics）是继基因组学、转录组学、蛋白质组学后兴起的新兴“组学”，以定量描述生物体内代谢物变化为目标。
